Las líneas de investigación del programa son el eje que ordenan las actividades que sustentan el quehacer científico de los PTC y ésta se entiende como el conjunto de actividades realizadas por los grupos de investigación y estudiantes, encaminadas a la generación y/o aplicación del conocimiento. Es en estas líneas de investigación que los estudiantes, asesorados por los profesores, construyen enfoques metodológicos para cumplir los objetivos del programa. En el Programa de Maestría en Ciencias existen tres áreas de especialidad a las cuales se encuentran asociados los profesores del núcleo académico básico, estas son: 1) Dra. Claudia Cortés García (coordinadora de área), Dr. José Rodríguez Lelis, Dr. Jorge Colín Ocampo, Dr. Andrés Blanco Ortega, Dr. Arturo Abúndez Pliego, Dr. Eladio Martínez Rayón, Dr. Enrique Alcudia Zacarías y Dr. Erik Rosado Tamariz. 2) Sistemas Térmicos: Dra. Yvonne Chávez Chena, Dra. Sara Moya Acosta, Dr. José Flores Prieto, Dr. Jesús Arce Landa, Dr. Rafael Campos Amezcua (coordinador de área), Dr. Miguel Ángel Chagolla Aranda y Dr. Efraín Simá Moo. 3) Biomecatrónica: Dr. Jorge Colín Ocampo, Dr. Andrés Blanco Ortega (coordinador de área), Dr. Arturo Abúndez Pliego y Dr. Eladio Martínez Rayón. Las líneas de generación y/o aplicación del conocimiento son: a) Diseño Mecánico, b) Energías Sustentables y Tecnologías en Edificaciones, y c) Biomecatrónica; cada una de estas líneas, cuenta con un coordinador y al menos un laboratorio para la investigación. Recientemente, en respuesta a las necesidades de investigación del CENIDET y del entorno, se formaron tres cuerpos académicos enfocados en temáticas específicas: Transferencia de Energía y Masa en Edificaciones para el Ahorro de Energía, Optimización del Comportamiento de Uniones y Sistemas Mecánicos, y Análisis, Diseño y Automatización de Sistemas Mecánicos. Así, nuestro programa de posgrado, está ligado a las actividades académicas respectivas que llevan las líneas de investigación y/o generación de conocimiento definidas, con el fin de formar recursos humanos de alta calidad para generar y aplicar conocimiento científico de frontera en el área de Ingeniería Mecánica con especialidad de Diseño Mecánico, Sistemas Térmicos y Biomecatrónica; como resultado, se tiene un egresado con un perfil para llevar a cabo investigación básica y/o aplicada en su ámbito profesional.